En las dos siguientes décadas, los 40 (llamada «La época negra») y los 50 (caracterizada por la alineación apodada como «Los millonarios») el Real Zaragoza vaga sin pena ni gloria por el Campeonato alternando ascensos y descensos de categoría. En febrero de 1941 se castellaniza el nombre del club por imperativo legal y el «Zaragoza Foot-ball Club» pasa a llamarse «Zaragoza Club de Fútbol», denominación que duraría una década.